Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms