Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF2Q9UNY4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms