Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPCN1Q9ULQ1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPCN1Q9ULQ1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
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