Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC37.07■■■■□ 3.53
ZNF608Q9ULD9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
ZNF608Q9ULD9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
ZNF608Q9ULD9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ZNF608Q9ULD9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC37■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC37■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ZNF608Q9ULD9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC36.95■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms