Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA11Q9UKX5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms