Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms