Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHIC2Q9UKJ5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHIC2Q9UKJ5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms