Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK10

ZNF225, Zinc finger protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF225Q9UK10 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF225Q9UK10 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF225Q9UK10 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms