Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms