Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXNA1Q9UIW2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXNA1Q9UIW2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXNA1Q9UIW2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXNA1Q9UIW2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXNA1Q9UIW2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXNA1Q9UIW2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXNA1Q9UIW2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXNA1Q9UIW2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXNA1Q9UIW2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXNA1Q9UIW2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXNA1Q9UIW2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXNA1Q9UIW2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXNA1Q9UIW2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PLXNA1Q9UIW2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNA1Q9UIW2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms