Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2IRD1Q9UHL9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms