Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms