Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT8Q9UFF9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms