Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms