Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms