Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms