Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALCOCO1Q9P1Z2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALCOCO1Q9P1Z2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO1Q9P1Z2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO1Q9P1Z2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO1Q9P1Z2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO1Q9P1Z2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO1Q9P1Z2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO1Q9P1Z2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO1Q9P1Z2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO1Q9P1Z2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO1Q9P1Z2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO1Q9P1Z2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO1Q9P1Z2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms