Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PHRF1Q9P1Y6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms