Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKIPSDQ9NZQ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms