Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms