Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN6Q9NWW5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms