Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms