Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms