Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms