Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8A2Q9NTI2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8A2Q9NTI2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8A2Q9NTI2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8A2Q9NTI2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8A2Q9NTI2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8A2Q9NTI2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8A2Q9NTI2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms