Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRP7BPQ9NSQ0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RRP7BPQ9NSQ0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms