Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms