Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM5Q9NQX1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM5Q9NQX1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms