Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LY9Q9HBG7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms