Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms