Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCAD1Q9H4L7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMARCAD1Q9H4L7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms