Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
CLSTN2Q9H4D0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms