Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms