Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNMDQ9H2S6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms