Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTIF3Q9H2K0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTIF3Q9H2K0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms