Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH19Q9H159 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH19Q9H159 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH19Q9H159 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH19Q9H159 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDH19Q9H159 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms