Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms