Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms