Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms