Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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