Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms