Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTNAP4Q9C0A0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms