Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM6SF1Q9BZW5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
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