Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SYCP2Q9BX26 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms