Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HERC2P3Q9BVR0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC2P3Q9BVR0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms