Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV38

WDR18, WD repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR18Q9BV38 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
WDR18Q9BV38 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR18Q9BV38 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms