Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTA3Q9BTC8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms