Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYT17Q9BSW7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYT17Q9BSW7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYT17Q9BSW7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYT17Q9BSW7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SYT17Q9BSW7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SYT17Q9BSW7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms