Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDHD3Q9BSH5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms