Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms